《二世之約》講述了加入弓道部的普通高中生白羽真奈，因為突發事件穿越到了戰國時期，遇見到了上杉政虎（即上杉謙信）。對于穿著“奇怪”、說著一口“未來”語言的真奈，上杉政虎感到非常有趣，于是將真奈帶回自己的居城春日山城，并命令自己的直屬忍者隊“軒猿眾”做為真奈的護衛。于是，一場圍繞著穿越時間的、在人人為每一天拼命的戰國亂世中為尋找自己存在意義的戀愛故事由此上演……